在国家863计划支持下，微生物基因组、红色毛癣菌、稻瘟病菌功能基因组研究取得重要进展。建成6个不同生长时相的红色毛癣菌cDNA文库，获得了约8000条unique的EST序列；鉴定出了3种可能与致病相关的蛋白质；应用基因芯片初步确定了一些红色毛癣菌独特的，以及浅部真菌所共有的一部分基因。构建了稻瘟病菌不同发育阶段及侵染状态下的cDNA文库，获得了约100条为全新的EST；构建了含有56000多个独立转化体的突变体库，克隆了2个新的稻瘟病菌致病基因。在破译维生素C生产菌株Kv菌全基因组的基础上，发现维生素C生产中的关键基因L-山梨酮脱氢酶和L-山梨糖脱氢酶等5个关键酶的基因，并利用其它生物技术方法对其进行了验证，已经申请国际PCT。对于维生素C生产工艺的改造并保持我国的国际市场份额（60%）具有重要意义。

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